子宮及陰道發育正常，初期後經血積存於陰道內，繼之擴展到子宮，形成陰道子宮積血，積血過多可流入輸卵管，透過傘部進入腹腔，傘部附近的腹膜受經血刺激發生水腫、粘連，致使輸卵管傘部閉鎖，形成陰道、子宮、輸卵管積血。經學進入腹腔，可形成內膜種植，造成子宮內膜移位症。
在青春期初潮前可無任何症狀。初潮後由於處女膜閉鎖而致經血無法排出。最初經血積在陰道內，多次月經來潮後，經血逐漸積聚，造成子宮、輸卵管積血，甚至腹腔內積血。
但輸卵管傘端多因積血而粘連閉鎖，故經血較少進入腹腔。處女膜閉鎖的女嬰在新生兒期多無臨牀表現。偶有幼女因大量粘液積聚在陰道內，導致處女膜向外凸出而被發現。
外陰陰道如果發生疾病，就會有可能不能進行性交或者使精液不能被接納，並且得病發生異常的陰道也會影響精子的功能而導致不孕，如處女膜閉鎖以及陰道閉鎖。
關於處女膜以及陰道閉鎖主要症狀是進入青春期會出現週期性的下腹疼痛並且沒有月經的出現。月經長時間在生殖道內瀦留，就會造成輸卵管積血，影響生育能力。